В классическом японском языке общепризнано выделение двух слоев: исконно японских и китайских заимствований. Вопрос более ранних истоков языка в традиционной науке не ставился. Первую работу по внешним связям японского языка опубликовал в 1857 году австриец Антон Боллер (1811—1869), доказывая его родство с урало-алтайскими. Новый этап исследования алтайских связей японского начинается после Второй мировой войны.